一般情况下，猫耳朵不脏，如果是健康的耳朵，不清理也无所谓。如果皮肤不好，比如幼猫时期曾经遭受细菌感染的猫咪，就需要定期清理耳垢了。另外，折耳猫的耳朵因为盖起来看不见耳道，主人也要定期检查一下比较好。正常猫咪的耳朵不需要清理。折耳猫需要定期检查一下。清理耳朵的频率约为一个月1-2次即可，过度清理反而会伤到耳朵。在清理耳朵时也可以顺便检查一下耳朵的健康。
猫咪耳朵最常出现的问题就是外耳炎，若发现耳垢有不正常增生就要注意了。如果是黄色的耳垢可能是细菌感染，而咖啡色耳垢则是真菌感染，黑色耳垢可能是耳疥虫。帮猫咪清理耳朵的方法是，用卫生纸沾一些动物专用的清耳液，轻轻地擦拭外耳即可。要注意的是，即使很在意耳朵深处的污垢，也千万不可以使用棉花棒。猫咪的耳道是呈现弯曲状，如果用棉花棒很可能会在猫咪挣扎中伤到耳道。
主人无需担心深处的耳垢，耳朵内部的耳垢会自然排出，只要清理外耳就可以了。另外，猫咪耳朵的皮肤是很娇嫩的，在清理的时候千万不要搓揉，轻轻擦拭过就好了！另外如果是个性比较好，比较配合的猫咪，可以将清耳液直接点入耳道中，这样深处的耳垢就会被清耳液溶解带出。如果猫咪很排斥的话，就不要强迫它，以免给它造成不必要的压力。当猫咪耳内黑呼呼时可能是长耳疥癣。
平时猫咪只须晃晃耳朵就能自然地将里面的耳垢和水分清除，所以主人可以不必经常为其清理耳朵。而当耳朵里面很脏时，把棉棒在婴儿化妆油里浸一下，在可视范围内清理耳内污垢。但是当猫咪出现经常搔耳和摇头症状的同时，耳道内有异味(酸臭味)，这时要警惕拉。首先，要检查猫咪的耳道，如果这个时候看见有多个红色疹状小结，这是可能是由耳螨唾液引起的刺激使外耳道红肿和发炎。
其次，猫咪耳朵内汇聚由外耳道皮脂腺分泌的蜡样物质，颜色和样子就象磨碎的咖啡豆。颜色为深褐色的。再观察耳廓是否广泛感染，鳞屑明显，角化过度。用耳镜检查耳道，可发现细小、白色或肉色的猫耳痒螨在褐色渗出物上运动。这时就可以确诊，猫咪得了耳螨。如果没有耳镜，用小型的LED灯也可以，主人手拿着LED灯对着猫耳道照射，会看见爬行的小虫，那就证明猫咪得了耳螨了。
通常情况下，猫耳朵患猫耳部疼痛明显，压痛，拒绝检查耳部。耳螨是猫的常见问题，大多数的猫都曾经得过的，但只要坚持给他擦，两周左右就可以治好，以后时不时的巩固一下就不会再有问题了。猫咪耳上如果有炎症或黑色污垢则是不正常，一般污垢只是在耳朵的表面，主人就可以自己为猫咪清除就可以了，但如果在耳道内，医院请兽医将其清除拉！！
